يعتبر قسم الجراحة أحد أهم اقسام كلية الطب الرئيسية حيث تبدى الطالب بأخذ بعض المبادئ الاساسية نظريا وعمليا خلال سنوات الكلية الاولى ثم يفرد للجراحة مقررين لدراستهما بتعمق أكثر ويكون الدراسة فيها مبنية على التعليم السريري ويصاحبه بعض المحاضرات وحلقات النقاش ثنائية الأداء وهذا مما ينعكس على اداء الطالب بشكل إيجابي ورائع في عملية استحضار واستظهار المعلومة ومزجها مع الخبرة السريرية لتكوين خطة علاجية ناجحة للمريض

كما يقدم قسم الجراحة مقررات طب وجراحة العيون وجراحة الانف والأذن والحنجرة

ويضم قسم الجراحة بكلية طب نجران التخصصات والفروع التالية

الجراحة العامة

التخدير

جراحة الاطفال

جراحة الأوعية الدموية

جراحة المسالك البولية

طب وجراحة العيون

جراحة المخ والأعصاب

جراحة التجميل

جراحة العظام

جراحة القلب والصدر

ويضم قسم الجراحة نخبة من الأساتذة المتخصصين والمعيدين المبتعثين